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武汉爱基百客生物科技有限公司(简称爱基百客),位于武汉高农生物园,办公面积逾3000m2,是一家专业提供单细胞与空间组学测序分析、表观组学科研服务和高通量测序分析的新型生物科技服务企业。

公司旨在为客户提供最专业的科研服务,运营至今合作的科研客户近千家,涵盖国内知名科研院所、高校以及相关生物企业,运营至今销售额超1亿元,科研成果曾多次在Cancer Cell、Plant Cell、Nature Communications、J HEMATOL ONCOL等国际高水平学术期刊发表,受到了客户广泛好评,是国内成长最迅速的高通量测序科研服务企业之一。

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扩增子测序

Q1: 请问宏基因组16sDNA测序与宏全基因组测序有什么区别?

A1:宏基因组微生物分类测序只测环境样品中一个基因(分子标记基因),而宏全基因组测序是随机测环境样品中所有的DNA;前者可以得到环境内物种组成情况,后者侧重了解环境中不同的功能基因组成情况,代谢途径。 通常情况下,在微生态研究中,建议将宏基因组16sDNA测序与宏全基因组测序相结合,可以更准确、全面的了解微生物菌落结构及功能情况。


Q2:我做微生物分类测序需要选择哪个区域更合适?

A2:细菌方面,一般做V3-V4区的比较多,我们认为它有一个比较好的覆盖度;真菌方面ITS主要针对真菌多样性研究,18S主要针对真核微生物。根据不同的样品及研究目的所用引物有一定差异,所以最终选择还是请以研究目的相的参考文献为准。


Q3:若关注环境中的真核微生物多样性,ITS测序和18S测序哪个更好?

A3:ITS测序主要是针对真菌多样性的研究,注释准确度高;18S测序针对的是真核微生物,注释到的范围广,但是就真菌来说精确度相对较低;可根据研究目的合理选择测序方案。


Q4:宏转录组一般推荐多少数据量?

A4:普通环境样本,推荐5G数据量,寄生或肠道微生物,推荐10G数据量,建议根据研究目的来选择数据量。


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