案例分析
《RNAm6A甲基化的改变促进亨廷顿⽒病⼩⿏海⻢记忆缺陷》
Alteredm6ARNAmethylationcontributestohippocampalmemorydeficitsinHuntington'sdiseasemice
期刊:CellularandMolecularLifeSciences|影响因⼦:8.0|发表时间:2022年|发表单位:巴塞罗那⼤学
研究背景:
N6-甲基腺苷(m6A)调节 RNA 代谢的许多⽅⾯,并参与学习和记忆过程。然⽽,m6A转录后编辑失调对神经退⾏性疾病中突触损伤的影响尚不清楚。
研究结果:
为了鉴定和表征 m6A RNA修饰模式,进⾏ m6A RNA 免疫共沉淀和测序(MeRIP-seq)。Peak的分布显⽰在所有条件下 m6A 密度在 CDS 和 3’UTR 有类似的富集。对 Peak 附近的序列进⾏分析,结果表明在不同条件下存在 m6A 共识位点 DRACH 的富集。这些数据表明,m6A分析结果与已发表的 m6A 特征相⼀致。MeRIP- seq分析发现,每种条件下约有30000 m6A Peak,对应于约11000 m6A修饰的mRNA。这与研究结果⼀致,即来⾃⽆症状的 Hdh+/Q111 ⼩⿏的 RNA 中m6A ⽔平升⾼,这些⼩⿏的 m6A 峰值的数量是 WT ⼩⿏的1.4倍。
图:WT 和 Hdh+/Q111(KI)⼩⿏海⻢中转录组范围内的 m6A 景观图谱