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武汉爱基百客生物科技有限公司(简称爱基百客),位于武汉高农生物园,办公面积逾3000m2,是一家专业提供单细胞与空间组学测序分析、表观组学科研服务和高通量测序分析的新型生物科技服务企业。

公司旨在为客户提供最专业的科研服务,运营至今合作的科研客户近千家,涵盖国内知名科研院所、高校以及相关生物企业,运营至今销售额超1亿元,科研成果曾多次在Cancer Cell、Plant Cell、Nature Communications、J HEMATOL ONCOL等国际高水平学术期刊发表,受到了客户广泛好评,是国内成长最迅速的高通量测序科研服务企业之一。

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详细说明

全基因组重测序

  • 产品介绍
  • 案例分析

全基因组重测序(Whole Genome Resequencing)


产品介绍:

全基因组重测序是对已知基因组序列的物种进行不同个体的基因组测序,并在此基础上对个体或群体进行差异性分析。全基因组重测序的个体,通过序列比对,可以找到大量的单核苷酸多态性位点(SNP),插入缺失位点(InDelInsertion/Deletion)和结构变异位点(SVStructure Variation)等信息,从而应用于检测致病基因、遗传变异、产前筛查、个性化医疗等众多领域。

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重测序实验流程


技术路线:

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样本要求:

细胞:>1×108 

动物组织:≥0.5 g

植物组织5 g

真核微生物:1 g


建库测序:

测序策略:Illumina Hiseq, PE150

测序深度:30×G


项目周期:

33个工作日


案例分析

《全基因组测序揭示卵巢癌化疗耐药性特征》

Whole genome characterization of chemoresistant ovarian cancer. Nature, 2015.(IF=43.07)


研究背景:

在过去的30年里,高级别浆液性卵巢癌(HGSC)患者的总体生存期几乎没有改善,标准治疗也没有进展到铂类联合化疗之外。


研究结果:

晚期浆液性卵巢癌(HGSCs)患者的存活率很低。为了更好的理解导致临床表型的原因,该研究选取92个浆液性卵巢癌患者原发实体瘤、腹水样本或尸检样本共114例及正常对照进行全基因组测序研究。重点关注前期化疗有效,后期产生化疗耐药性的患病个体。在产生化耐药性的个体中频繁检测到CCNE1基因突变,通过检测不同治疗阶段癌细胞的变异情况,发现破坏失活肿瘤抑制基因RB1NF1RAD51BPTEN,导致获得化疗耐药性。此项研究揭示了在化疗选择压力下HGSCs患者基因组的异质性和适应性,在选择化疗方案作为HGSC的治疗手段时,需要采用必要的策略避免产生化疗耐药性。

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图:高分化期浆液性卵巢癌存在高频基因组重排



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