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样本处理及建库系统 / 二代测序系统
二代测序系统

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武汉爱基百客生物科技有限公司（简称爱基百客），位于武汉高农生物园，办公面积逾3000m2，是一家专业提供单细胞与空间组学测序分析、表观组学科研服务和高通量测序分析的新型生物科技服务企业。

公司旨在为客户提供最专业的科研服务，运营至今合作的科研客户近千家，涵盖国内知名科研院所、高校以及相关生物企业，运营至今销售额超1亿元，科研成果曾多次在Cancer Cell、Plant Cell、Nature Communications、J HEMATOL ONCOL等国际高水平学术期刊发表，受到了客户广泛好评，是国内成长最迅速的高通量测序科研服务企业之一。

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网站首页 >> 科技服务 >>转录调控相关研究 >> RNA-seq

详细说明

RNA-seq

产品介绍
案例分享

RNA-seq

产品介绍：

转录组，广义上指某一生理条件下，细胞内所有转录产物的集合，包括mRNA、rRNA、tRNA以及其他非编码RNA，狭义上的转录组指的是所有mRNA的集合。目前转录组检测的是所有mRNA集合。

转录组测序指利用新一代高通量测序技术，全面快速获取某一物种特定组织或器官在某一状态下的所有mRNA的序列信息。

技术流程：

样本要求：

细胞：＞1×108个

动物组织：≥0.5 g

植物组织：≥5 g

真核微生物：1 g

建库测序：

测序策略：Illumina Hiseq, PE150

测序深度：12-20 G

项目周期：

45个工作日

案例分享

《月季“月月红”热应激反应的关键因素和信号传导途径的转录组比较分析》

Comparative transcriptome analysis of Rosa chinensis ‘Slater's crimson China’ provides insights into the crucial factors and signaling pathways in heat stress response. Plant Physiology and Biochemistry. 2019,142:312-331.（IF=3.404）

研究背景：

热胁迫限制了月季的生长，并且不利地影响了月季切花的产量和质量。但是月季的热应激反应（HSR）机制目前尚未完全清楚。

研究结果：

鉴定了6175个差异表达基因（DGE），它们表现出不同的时间表达模式。热处理0.5–2h后，与伴侣蛋白介导的蛋白质折叠，信号转导和ROS清除相关的上调基因被迅速诱导，这为月季的热应激反应的早期调节提供了证据。在短短6h的热胁迫下就发现了与光反应，蔗糖生物合成，淀粉生物合成和细胞壁生物合成相关的基因下调，这表明其对月季的生理作用一直在发挥负面作用。在将转录因子与共表达基因的上游富集DNA基序整合到这些模块中的基础上，预测并调控了基因调控网络。确定了几个HSR的调节器。特别重要的是发现了与快速传感和信号转导相关的模块，其中鉴定了与分子伴侣、Ca 2+信号传导途径和转录因子相关的许多共表达基因。