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2023年度盘点|爱基百客表观产品全面开花，平均影响因子10+时序更替，岁物丰成 回首2023 爱基百客坚守初心，勇毅向前 我们携手风雨，不断成长 这一年，爱基百客20+表观组学产品，全方面满足科研需求。 这一年，爱基百客表观产品稳步推进，成果丰硕，项目物种全面覆盖人、动物、植物和微生物，研究方向涉及铁死亡、线粒体功能和植物免疫响应等热门方向。
据不完全统计，爱基百客2023年表观组学文章平均影响因子10+，涉及医学、农业等不同方向，单篇影响因子高达37.8，且多篇文章发表于Circulation、Nature Communications、Plant Biotechnology Journal、Plant Communications和Genome Biology等高水平期刊。
2023年11月23日，国际知名期刊Circulation（IF:37.8）在线发表了武汉大学人民医院心内科唐其柱教授团队题为“USP28 Serves as a Key Suppressor of Mitochondrial Morphofunctional Defects and Cardiac Dysfunction in the Diabetic Heart” 的文章。该研究证实了USP28在糖尿病心脏中的保护作用，尤其是在长期糖尿病的情况下，它能改善心脏的收缩和舒张功能，减轻心脏肥大和纤维化。该研究利用RNA-seq、ChIP-seq（均由爱基百客提供）、质谱分析和蛋白pull-down等技术手段发现USP28（泛素特异性蛋白酶28）直接与PPARα（过氧化物酶体增殖物激活受体α）互作，去泛素化和稳定PPARα，促进Mfn2转录，从而阻碍线粒体形态功能缺陷。 文章详细解读：喜讯 | Circulation（IF:37.8）ChIP-seq+RNA-seq助力解析USP28在糖尿病性心脏病的调控机制
 2023年，Redox Biology（IF: 10.787）在线发表北京大学深圳医院/江西中医药大学题为“Energy stress modulation of AMPK/FoxO3 signaling inhibits mitochondriaassociated ferroptosis”的研究论文。该研究发现FoxO3a激活剂三氟拉嗪（TFP）（一种经FDA批准的抗精神病药物），可以通过AMPK/FoxO3a/HIF-1α/SLC7A11信号通路和线粒体依赖机制减少大鼠铁死亡相关的缺血—再灌注损伤。其中，通过干实验ChIP-seq和湿实验结合发现与SLC7A11启动子结合的Fox03a抑制了其表达。
 2023年11月23日，国际知名期刊Nature Communications（IF:16.6）在线发表了中山大学题为 “Regulation of the physiology and virulence of Ralstonia solanacearum by the second messenger 2′,3′-cyclic guanosine monophosphate”的研究论文。该研究报道了2‘，3’-环磷酸鸟苷（2‘，3’-cGMP）通过转录调控因子RSp0980控制青枯雷氏菌的重要生物学功能，群体感应（QS）信号系统和毒力。
 2023年安徽农业大学陈晓洋/潘月敏团队在期刊Plant Biotechnology Journal（IF:13.8）发表了题为“Ustilaginoidea virens-secreted effector Uv1809 suppresses rice immunity by enhancing OsSRT2-mediated histone deacetylation”的研究论文。该研究结果表明Uv1809是针对水稻组蛋白去乙酰基酶OsSRT2的关键效应因子，Uv1809通过促进OsSRT2介导组蛋白去乙酰化，降低宿主中H4K5ac和H4K8ac的水平，干扰防御基因转录的激活。该研究揭示了一种新的反防御机制，植物病原体通过分泌效应器来干扰宿主的表观遗传修饰，从而使宿主防御反应失活。 文章详细解读：项目文章| PBJ（IF:13.8）发表稻曲病菌效应因子Uv1809增强组蛋白去乙酰化抑制水稻免疫的分子机制
 2023年7月5日郑州大学农学院棉花生物育种与综合利用国家重点实验室的李付广/杨作仁研究员团队在Physiologia Plantarum（IF: 6.4）发表题为“Characterization of chromatin accessibility and gene expression reveal the key genes involved in cotton fiber elongation”的研究论文。该研究利用ATAC-seq联合RNA-seq技术在WT和Li2突变体进行纤维伸长转录因子和基因鉴定，探究纤维发育过程中的分子/遗传机制，为棉纤维伸长提供了新的见解。
2023年南京农业大学和江苏省农业科学院植物保护研究所研究团队在期刊Journal of Integrative Agriculture（IF:4.8）发表了题为“Sigma factor 70 RpoD contributes to virulence by regulating cell motility, oxidative stress tolerance, and manipulating the expression of hrpG and hrpX in Xanthomonas oryzae pv. Oryzae”的研究论文。该研究结果表明：σ70因子RpoD在植物病原菌相当保守的。在水稻白叶枯病（Xoo）中，PXO_RpoD在氧化应激耐受性和细胞运动中发挥重要作用，也是全面毒力所必需的。此外，CUT&Tag分析表明，RpoD通过调节hrpG和hrpX来调节T3SS。进一步验证表明RpoD直接与hrpG和hrpX启动子结合。 文章详细解读：项目文章 | CUT&Tag助力解析水稻白叶枯病菌Sigma因子70 RpoD的致病作用
 2023年7月28日，中国科学院植物研究所秦国政研究员课题组在The Plant Cell（IF: 11.6）上在线发表了题为“Deciphering the regulatory network of the NAC transcription factor FvRIF, a key regulator of strawberry fruit ripening”的研究论文，该研究揭示了NAC转录因子FvRIF在草莓果实成熟调控中的功能，通过DAP-seq在全基因组水平鉴定了FvRIF的靶基因，并阐明了蛋白质磷酸化修饰对于FvRIF活性的调节作用。
2023年湖北科技学院陈洪国教授团队在园艺学科领域一区杂志Postharvest Biology and Technology（IF：7）上发表题为“DNA hypomethylation mediates flower opening and senescence in sweet osmanthus through auxin and ethylene responsive pathways”的研究性论文。该研究对桂花全基因组DNA甲基化和转录组谱进行综合分析，研究表明花的开放和衰老由DNA去甲基化调控，通过介导特定基因家族的表达，以及植物激素生长素和乙烯，将花转变为开放和衰老的状态。DNA低甲基化介导OSUAR和OfERF基因调控桂花开放和衰老的分子机制有待进一步研究。 文章详细解读：项目文章解读 | DNA低甲基化介导的桂花衰老 作为提供领先表观组学的技术服务商，爱基百客一直致力于表观组学相关的知识分享。2023年我们在表观组学方面产出100+文章，持续进行干货输出。 与此同时，我们还以线上直播的形式来进行分享，解析研究思路，助力表观组学研究。此外，我们成功开启爱基论坛一作直播，邀请一作老师分享科研思路，深入探讨交流，启发灵感火花。更多精彩内容，敬请期待2024！  2023年，是成就与奋斗的一年，爱基百客非常荣幸与广大客户进行合作，共同在表观组学方面不断深入探索。2024年，爱基百客再度启程，我们秉承提供领先表观组学技术的理念，将持续提供优质技术服务。期待与您携手合作，共同前行！
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