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武汉爱基百客生物科技有限公司(简称爱基百客),位于武汉高农生物园,办公面积逾3000m2,是一家专业提供单细胞与空间组学测序分析、表观组学科研服务和高通量测序分析的新型生物科技服务企业。

公司旨在为客户提供最专业的科研服务,运营至今合作的科研客户近千家,涵盖国内知名科研院所、高校以及相关生物企业,运营至今销售额超1亿元,科研成果曾多次在Science、Cancer Cell、Plant Cell、Nature Communications、J HEMATOL ONCOL等国际高水平学术期刊发表,受到了客户广泛好评,是国内成长最迅速的高通量测序科研服务企业之一。

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TECHNOLOGY SERVICE

科技服务

详细说明

CUT&Tag

  • 产品介绍
  • 案例分享

CUT&Tag ( Cleavage Under Targets and Tagmentation )


产品介绍:

CUT&Tag是研究蛋白和DNA互作的新兴实验方法,该方法是通过蛋白特异性抗体引导Protein A-Tn5酶在目标蛋白结合的DNA位置进⾏切割并且在序列两端加上测序接头,经过 PCR扩增后形成可以用于高通量测序的文库,随后对文库进⾏测序分析从而解析与目标蛋白结合的DNA 片段。 

CUT&Tag具有低细胞起始量、信噪比高、背景⼲净等优点。


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CUT&Tag实验流程


分析流程:

CUT&Tag分析流程图.png


技术优势:

CUT&Tag技术优势.png


样本要求:

细胞:5×104 

动物组织:0.1 g

植物组织1 g

核微生物:300 mg

 

建库测序:

测序策略:NovaSeq6000, PE150

测序深度:3 G


项目周期:

35个工作日 



案例分析

《H3K18乳酸化标记组织特异的活性增强⼦》

H3K18lactylationmarkstissue-specifcactiveenhancers

期刊:GenomeBiol|影响因⼦:17.906|发表时间:2022年|发表单位:瑞⼠苏黎世联邦理⼯学院


研究背景:

在⼈类、⼩⿏、植物、真菌和寄⽣⾍样本中已经报道了超过30个组蛋⽩乳酸化位点。H3组蛋⽩18位的赖氨酸残基的乳酸化已经进⾏了⼀些深⼊研究,研究显⽰其在基因启动⼦上⾼度富集,并与癌细胞和巨噬细胞中的相关基因的活跃表达有关。但迄今为⽌,⼤多数的Kla的报道集中在总Kla⽔平的变化,但全基因组H3K18la分布及其与其他组蛋⽩修饰和基因表达的关系报道较少。


研究结果:

该研究利⽤CUT&Tag技术⽣成了⼩⿏和⼈组织的 H3K18la 分布的全基因组数据集,其中这些组织覆盖到多代谢状态 。监督(与公共数据重叠)和⽆监督(ChromHMM)分析反映H3K18la除了活性启动⼦,还标记组织特异的活性增强⼦。研究中还有⼀个兴奋的发现,活性CGI 启动⼦上的H3K18la 可能主要标记启动⼦嵌⼊的增强⼦序列,使得H3K18la成为与H3K27ac部分不同的组蛋⽩翻译后修饰的增强⼦标记。

 CUT&Tag案例分析.png

图:H3K18la标记了活性的CGI 启动⼦



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