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武汉爱基百客生物科技有限公司(简称爱基百客),位于武汉高农生物园,办公面积逾3000m2,是一家专业提供单细胞与空间组学测序分析、表观组学科研服务和高通量测序分析的新型生物科技服务企业。

公司旨在为客户提供最专业的科研服务,运营至今合作的科研客户近千家,涵盖国内知名科研院所、高校以及相关生物企业,运营至今销售额超1亿元,科研成果曾多次在Science、Cancer Cell、Plant Cell、Nature Communications、J HEMATOL ONCOL等国际高水平学术期刊发表,受到了客户广泛好评,是国内成长最迅速的高通量测序科研服务企业之一。

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详细说明

单细胞转录组10xGenomics

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单细胞转录组(scRNA-seq


产品介绍:

10x Genomics利⽤微流控、油滴包裹、barcode的技术⼿段在单个细胞层⾯对细胞mRNA进⾏⾼通量测序。针对制备成功的单细胞悬液,通过微流控技术分选单个细胞,然后将带有barcode和引物的凝胶珠与单个细胞包裹在油滴中,形成GEMsGEMs形成后,在GEMs中完成细胞的裂解以及mRNA的捕获,随后mRNA逆转录最终⽣成含有10x BarcodeUMIcDNA,最后进⾏测序⽂库的构建与测序分析。10x Genomics单细胞平台细胞捕获率最⾼65%,单个样本建议捕获500 - 10000个细胞,⼀张芯⽚可完成80,000个细胞的捕获,结合配套分析软件,可⼀次性获得⼤量单细胞的基因表达数据。现10x Genomics单细胞转录组测序⼴泛应⽤于动植物细胞图谱构建、稀有细胞类型鉴定、疾病发⽣机制解析、发育分化机制研究等⽅⾯。


技术流程:

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样本要求:

总量≥105⽬标细胞个数(最少10,000个细胞);

细胞间⽆粘连(成团率<5%);

⽆⼤于40μm的细胞碎⽚或其他颗粒物; 

不存在逆转录抑制剂和⾮细胞的核酸分⼦;

浓度700-1,200 /μl; 

细胞成活率应⼤于85%

有完整的基因组。


建库测序:

测序量:100G


项目周期:

40个⼯作⽇




案例分享

【项⽬⽂章】《胶质⺟细胞瘤恶性细胞与⾎管细胞谱系关系的解析》

Resolvingthelineagerelationshipbetweenmalignantcellsandvascularcellsinaglioblastomas

期刊:Protein&Cell|影响因⼦:15.328|发表时间:2022年|发表单位:武汉⼤学中南医院


研究背景:

多形胶质⺟细胞瘤(Glioblastoma  multiform, GBM)是⼀种⾼度恶性、异质性的脑肿瘤,包含多种类型的肿瘤和⾮肿瘤细胞。GBM细胞是否可以转分化为⾮神经细胞类型,包括壁细胞或内⽪细胞,以⽀持肿瘤⽣⻓和侵袭仍存在争议。破译GBM微环境的细胞组成和谱系历史,包括内⽪细胞、壁细胞和肿瘤相关的⼩胶质细胞和巨噬细胞,对开发GBM的靶向治疗具有重要意义。GBM细胞被认为起源于突变的神经⼲细胞/祖细胞。先前的研究表明,GBM⼲细胞可能产⽣⾎管内⽪细胞(ECs)或壁细胞⽀持肿瘤⽣⻓和侵袭。作者早期的研究还发现,⼲细胞标志物既可以标记胶质瘤⼲细胞样细胞,也可以标记壁细胞,提⽰胶质⺟细胞瘤细胞可能存在跨谱系的转分化。最新的单细胞技术结合谱系追踪分析,对理解在发育过程、组织稳态、再⽣和 病理条件下的细胞成分、细胞状态和命运分化有深刻的意义。


研究内容:

该研究在⼩⿏中⽣成了2个遗传GBM模型,模拟⼈类GBM的基础病理和分⼦特征。作者对谱系进⾏了追踪,并利⽤单细胞RNA-seq对拷⻉数变异进⾏了分析。该研究促进了对GBM细胞谱系潜⼒的理解,并可能为GBM患者的靶向治疗提供⻅解。

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图:NPCTKD GBM样本中⾎管细胞和恶性细胞的CNV模式和分布



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