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样本处理及建库系统 / 二代测序系统
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武汉爱基百客生物科技有限公司（简称爱基百客），位于武汉高农生物园，办公面积逾3000m2，是一家专业提供单细胞与空间组学测序分析、表观组学科研服务和高通量测序分析的新型生物科技服务企业。

公司旨在为客户提供最专业的科研服务，运营至今合作的科研客户近千家，涵盖国内知名科研院所、高校以及相关生物企业，运营至今销售额超1亿元，科研成果曾多次在Science、Cancer Cell、Plant Cell、Nature Communications、J HEMATOL ONCOL等国际高水平学术期刊发表，受到了客户广泛好评，是国内成长最迅速的高通量测序科研服务企业之一。

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详细说明

Small RNA-seq

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Small RNA-seq

产品介绍：

smallRNA是生物体内⼀类重要的功能分子，广泛存在于高等和低等生物体内。SmallRNA与细胞的发育、分化、疾病等密切相关。近年来的研究表明，smallRNA不仅可作为癌症诊断、识别、预后的标志物，也在癌症治疗中发挥作用。

smallRNA包括microRNA、siRNA、snoRNA、piRNA等。它们的主要功能是诱导基因沉默，调控细胞生长、发育、基因转录和翻译等生物学过程。通过mRNA降解、翻译抑制、异染色体形成以及DNA去除等多种途径，广泛的参与调控⽣物体的生长发育和疾病发生。基于新⼀代⾼通量测序技术的smallRNA 测序，可⼀次性获得数百万条small RNA 序列，能够快速地鉴定某种组织在特定状态下的所有已知smallRNA并发现新的smallRNA，以及预测smallRNA靶基因，为smallRNA功能研究和调控机制提供有力的工具。

分析流程：

miRNA分析流程.png

样本要求：

细胞：≥1×10⁶个

动物组织：≥3 g

植物组织：≥1g

真核微生物：≥300mg/10⁶

建库测序：

测序策略：SE50

测序量：10-20 M

适用范围：有参考基因组物种

项目周期：

45个工作日

案例分享

【项⽬⽂章】《转录组和miRNA测序联合分析揭⽰矮牵⽜花形态发育的动态调控机制》

AnIntegratedAnalysisofTranscriptomeandmiRNASequencing

ProvidesInsightsintotheDynamicRegulationsduringFlowerMorphogenesisinPetunia

期刊：Horticulturae｜影响因⼦：2.923｜发表时间：2022年｜发表单位：中南林业科技⼤学园林学院

研究背景：

花是植物中最复杂的结构，探索其形成的调控机制在进化和⽣殖⽣物学中具有重要意义。迄今为⽌，研究发现花的形成涉及不同的发育过程，如花分⽣组织命运的诱导、花器官特性的确定、花器官的形态建成和成熟等。除了转录⽔平的遗传机制外，表观遗传调控因⼦，尤其是microRNAs，参与了花发育的许多⽅⾯。因此，该研究以转录组和 miRNA 测序为⼯具分析了花形态建成过程中的调控机制。

研究结果：

该研究利⽤RNA-seq 和miRNA测序全⾯描述了矮牵⽜5个花发育阶段的mRNA和miRNA的动态表达谱。⼤量的候选基因和miRNAs被鉴定出来，表现出时间表达模式的特征。在表达基因中观察到共表达模式，并提⽰存在新的miRNA-mRNA通路。对DEGs 和DEMs的靶基因进⾏富集分析表明碳⽔化合物代谢、光合作⽤、苯丙氨酸代谢和植物激素途径在花发育过程中起着重要作⽤。这些结果将有助于进⼀步研究转录因⼦的特异性、不同发育阶段的基因调控机制以及花形态差异的遗传基础。

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