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武汉爱基百客生物科技有限公司(简称爱基百客),位于武汉高农生物园,办公面积逾3000m2,是一家专业提供单细胞与空间组学测序分析、表观组学科研服务和高通量测序分析的新型生物科技服务企业。

公司旨在为客户提供最专业的科研服务,运营至今合作的科研客户近千家,涵盖国内知名科研院所、高校以及相关生物企业,运营至今销售额超1亿元,科研成果曾多次在Science、Cancer Cell、Plant Cell、Nature Communications、J HEMATOL ONCOL等国际高水平学术期刊发表,受到了客户广泛好评,是国内成长最迅速的高通量测序科研服务企业之一。

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详细说明

空间转录组(Visium Spatial Gene Expression)

  • 产品介绍
  • 案例分析

空间转录组(Visium Spatial Gene Expression


产品介绍:

细胞之间的关系以及它们在组织样本中的相对位置对于⽣命活动具有重要影响,空间转录组是将mRNA的表达丰度与空间位置结合,为细胞功能、表型和组织微环境中位置的关系提供了重要信息。其原理是当组织冷冻切⽚附在空间转录组载⽚上时,条形码引物结合并从组织中捕获临近的mRNA。被捕获的mRNA开始逆转录,得到的cDNA中包含了空间条形码。分析Illumina测序结果中空间条形码的序列,可以将每个mRNA转录的序列映射回组织切⽚中的真实位置。


技术流程

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芯片原理

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样本要求:

新鲜组织OCT包埋


建库测序:

测序量:5M reads / spot


项目周期:

40个工作日


案例分享

【项⽬⽂章】《单细胞和空间组学分析揭⽰了乳腺癌的细胞异质性》

Single-cellandspatiallyresolvedanalysisuncoverscellheterogeneityofbreastcancer

期刊:JHEMATOLONCOL|影响因⼦:23.168|发表时间:2022年|发表单位:武汉⼤学⼈⺠医院



研究背景:

乳腺癌常常被称为“粉红杀⼿”,其发病率居于⼥性恶性肿瘤的⾸位。乳腺癌(BC)的特征之⼀是复杂的细胞⽣态系统,基于乳腺癌分⼦分型的诊断和治疗取得了重⼤进展,但其内部的异质性尚不清楚。在该研究中,作者的⽬标是结合两种互补的⾼分辨率组学(单细胞核RNA测序和空间转录组)⼯具来解读乳腺癌的异质性和复杂结构。


研究结果:

在该研究中,作者发现乳腺癌恶性细胞分为不同的亚群,这些亚群有不同的功能、特征和起源, 亚群映射到不同的组织区域。另外,通过分析推断这些肿瘤亚群的丰度,揭⽰患者⽣存率和治疗反应的差异关系。总之,该研究提供了⼀个描绘乳腺癌异质性和结构的综合性⽅法。同时, 它也将有助于临床医⽣对乳腺癌“分⻔别类”的精准治疗。

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图:空间转录组分析和细胞类型的反褶积

 



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